クリアするとNewGame+がプレイ可能になる。☆が付いたクリア直後のデータでしか引き継ぎできない。
(☆はセーブをし直すと消えてしまう。前作「サガ2GOD」とは異なるので、前作経験者は特に注意したい。)
ただしNewGame+で始めたデータは☆が付いたままなので、途中でもデータを引き継ぐことができる。フリーシナリオをさっさと埋めたい人は推奨。
基本概要 
引き継ぐ内容は…
- 特性以外のステータス(熟練度含む)、アイテム(イベントアイテム除く)、倉庫に預けているアイテム、装備品(聖剣・イージスの盾・リモコン除く)、所持金、プレイヤーノートの内容(ストーリーノートを除く)。
- 種族は引き継がれない。能力や特性も全部リセットされる。
- NPCのステータスや技等は引き継がれない。
- 名前やカラーは引き継がれない。
1周目と同じ流れで名前入力、カラー選択する。
前の周途中でニューカラーのパスワードを入力していた場合、次周でも反映される。
- 6文字パスワード入力履歴はリセットされるので再入力が必要。4文字はリセットされないので一度入力したものは使用不可。
なお開始時の選択肢により、プレイヤーノートのみ引き継ぐことも可能。
- 能力値、所持金、所持アイテムなどがリセットされる。
- 4文字パスワード入力履歴もリセットされるので再使用可。カラー5を使用したい場合はキャラメイキング前にパスワード入力が必須。
バグ情報
※ノートのみ引き継ぎの場合、ジュークボックスから「戦士の休息」「輝ける未来へ」の2曲が消失? 要検証
※ジュークボックス入手直後のノートのみ引き継ぎデータがあったので検証してみました。
- ノートのみ引き継ぎの場合はジュークボックスのデータはリセットされる。2曲は勿論、ジューク入手までに聴いてない曲(神戦とか)も「?」化。
- わざと全滅させてリトライした後、ジュークボックスを付けてみたが「戦士の休息」は「?」のまま(全滅が「戦士の休息」解禁フラグでは無い)
- 2曲の解禁フラグといわれるタイトルデモをスキップせずに該当のデータを始めてみたが「輝ける未来へ」は「?」のまま。
- 引き継ぎ元になった方のデータ(引き継ぎありで3周している)のジュークボックスは2曲とも消えていない。(引き継ぎ無し開始をしても他のデータには影響しない?)
- 2曲が無いセーブデータがある状態で、「NewGame」で新規に始めてみたら2曲ともあった。(2曲は通常はデフォルトで解禁されている?)
「NewGame+でノートのみ引き継ぎ」で始めた際に解禁曲がリセットされるのに、2曲の解禁フラグは復活しないのが原因みたい。
もうちょっと検証必要ですが、今のところは2曲が消えていない全引き継ぎデータを常に残しておくのを推奨。
2周目以降限定の要素 
HARDモードが選択できる。EASYモードの選択が不可能になる。
HARD限定のハント、発掘クエストが割りとある。
NewGame+で開始した時のみ発生するフリーシナリオが割とある。
HARDモードについては☆データさえあればNewGame+を選ぶ必要はない。
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