サブクエスト 
いくつ受けても大丈夫。(受注しておいて問題ない)
メニューのクエスト確認で確認できる。
本編を進めれば自然と出る。
サブクエストのイベントで出現する敵はザコの時よりもかなり強くなっているので注意
01-狙われた街 
条件:初期
報酬:つるつるの皮x3
場所:ビギンズ・キューブ-中央地区-北東
必要キャラ:なし
ボス:メトロン星人
- ビギンズ・キューブ-中央地区-北東(3×3の9マスの小部屋)
- ビギンズ・キューブ-西地区-回復拠点から西の通路
メトロン星人とバトル
02-セルメダルの収集 
条件:初期
報酬:バッタカンドロイド
場所:ビギンズ・キューブ-中央地区
必要キャラ:なし
- ビギンズ・キューブ-中央地区
白ヤミーを倒すごとに10枚セルメダルが手に入る
※屑ヤミーでは手に入らないので注意
- 100枚集める
03-幻の怪獣 
条件:
報酬:白銀の髭x3
場所:ビギンズ・キューブ-中央地区-南西
必要キャラ:ウルトラ戦士
ボス:ウー
- ビギンズ・キューブ-中央地区-南西
ウーとバトル
04-マグアナックの依頼 
条件:
報酬:なし(Zガンダムのスキル開放)
場所:デザート・キューブ-流砂地区-南東
必要キャラ:Zガンダム
ボス:モールイマジンx3
- デザート・キューブ-流砂地区-南東
マグアナックと話す
- アントラーの巣のあった位置へ向かう
- モールイマジンx3とバトル
ハイパーメガランチャーが手に入る
05-謎のモビルスーツ 
条件:ジ・O撃破後出現
報酬:蜘蛛の糸、切れない粘糸
場所:デザート・キューブ-荒野地帯
必要キャラ:Zガンダム
ボス:ハンブラビ、マグマ・D、アイスエイジ・D
- デザート・キューブ 荒野地帯の北西へ向かう
ハンブラビ、マグマ・D、アイスエイジ・Dとバトル
06-サイコミュ兵器 
条件:ジ・O撃破後出現
報酬:なし(νガンダムのスキル開放)
場所:デザート・キューブ-軍事基地 西部
必要キャラ:νガンダム、Zガンダム
ボス:ヤクト・ドーガ
- デザート・キューブ-軍事基地-回復地点のすぐ近くの空き部屋(宝箱がなかった部屋)で箱を調べる
- 南部(入れなかった扉の先)を探索する(νとZ両方とも育てていない場合は探索だけでもキツイので注意)
- 最奥の部屋でヤクト・ドーガとバトル
扉の前に立つとバトルになるので先に回復しておくこと
クリアすることでνガンダムがフィン・ファンネル装備型にパワーアップ
07-2体のモビルドール 
条件:巨大ヤプール撃破後
報酬:プラネイトディフェンサー
場所:デザート・キューブ-軍事基地-東
必要キャラ:ウィングゼロ
ボス:ヴァイエイト、メリクリウス
- デザート・キューブ-軍事基地-東の小部屋に向かう
(RXが捕まっていた大部屋からすぐ下にいった場所)
- ヴァイエイト、メリクリウスとバトル、倒せばクリア
ヴァイエイトは攻撃力が高く、素早い
メリクリウスは攻撃力は低いが敵全体に間防アップをかける、また、一体になると物防アップ、間防アップを使う?
08-クレージーゴン討伐 
条件:巨大ヤプール撃破後
報酬:なし(サブクエストNo12開放)
場所:デザート・キューブ-流砂地区-南
必要キャラ:ダブルオー
- デザート・キューブ-流砂地区-南(奥の流砂のない箇所)
- マグアナックと話す
- 奥にいるクレイジーゴンに話しかけてバトル
クレイジーゴン HP2150
- さらに奥にいるクレイジーゴンに話しかけてバトル
クレイジーゴン HP2150
- 最奥にいるクレイジーゴンに話しかけてバトル
クレイジーゴン HP2150
壊れたオーライザーを入手
- 戻ってマグアナックと話すとクリア
09-アントラー、再び 
条件:巨大ヤプール撃破後
報酬:なし(サブクエスト10、11開放)
場所:デザート・キューブ-廃墟地帯中央部
必要キャラ:なし
ボス:アントラー
- デザート・キューブ-廃墟地帯中央部-CBキャンプの左下
マグアナックと話す
- さらに左下で戦闘
アントラー HP8235
全体暗闇攻撃を使ってくるのでロックオンがあると戦いやすい
クリアするとNo10、No11のサブクエストが受注できるようになる
10-奇妙な訪問者 
条件:09-アントラー、再びクリア
報酬:なし(サブクエスト??開放)
場所:アジト・キューブ-採石場南-墓場
必要キャラ:ウルトラマン
ボス:バルタン星人
- アジト・キューブ-採石場南-墓場、入り口辺りにいるマグナックと話す
- 採石場北(西側)奥でバルタン星人とバトル
光が弱点なので光属性の単体光線技が使えるとかなりラク
分身で回避率をあげてくる
11-哀しみの王子 
条件:09-アントラー、再びクリア
報酬:なし(RXのスキル開放)
場所:ビギンズ・キューブ-西地区
必要キャラ:仮面ライダーBLACKRX
ボス:スカル魔
- ビギンズ・キューブ-西地区の縦長い部屋(中継地点3のすぐ東)に行く
- そのとき、不思議なことが起こった
- スカル魔とバトル
光弱点だがスカル魔はかなり弱いので何も考慮しなくても倒せる
12-オーライザーの回収 
条件:サブクエスト08クリア、ウルトラキューブ第三層到達
報酬:ダブルオーのスキルツリー開放
場所:アジト・キューブ-研究所-B1階
必要キャラ:ダブルオー
ボス:アヘッド&アヘッドスマルトロン
- アジトキューブ中継地点1の近くにいるマグアナックに話しかける
- アジトキューブ研究所B1階、中継地点1からスタートして
ショートカットを通る→1歩進んだ右の扉に入る→そのまま進んで分かれ道にきたら左に行き突き当たり右のドアに入る
部屋に入るとアヘッド&アヘッドスマルトロンと戦闘。勝利するとクリア
13-噂の大盗賊団 
条件:ウヴァ撃破後
報酬:電王のスキルツリー解放
場所:ウルトラ・キューブ-第4層-宝物庫
必要キャラ:電王
ボス:ガオウ
- ダメージ床地帯からいけるリフトから第4層に降り少し進むとガオウと戦闘
攻撃力がかなり高く、HP700以下では単体スキル1発で即死する威力なので出現直後に行くときついかもしれない
倒せばクリア
14-究極のアイス 
条件:
報酬:フェイロン・フラッグ
場所:ウルトラ・キューブ-第3層-東部
必要キャラ:なし
ボス:スイーツ・ドーパント
- 第3層東側、マップ上で下側にある宝箱の場所まで行く。
- スイーツ・ドーパントと戦闘。雑魚と違ってHPが高い。
15-ヴェーダ機密情報 
条件:
報酬:なし
場所:ショッカー・キューブ-第1層-南西の小部屋
必要キャラ:ダブルオー
ボス:マスラオ
- 南西部の行き止まりの小部屋は、宝箱が2つあった小部屋のこと。
- 部屋に入って少し進むとマスラオと戦闘。
16-逆襲のバルタン星人 
条件:
報酬:無重力弾
場所:アジト・キューブ-採石場-南&北
必要キャラ:ウルトラマン
ボス:バルタン星人×3
- 採石場南の墓場でマグアナックから話を聞く。
- 採石場北の東側エリアに行く。十字架の場所まで行くとバルタン星人3体と戦闘。
1体HP8000程度で、攻撃力と防御力はそれほど高くない。
17-影の王子 
条件:
報酬:なし
場所:ショッカー・キューブ-第2層-南部
必要キャラ:RX
ボス:シャドームーン
- 1階南から2階に登り、道なりに少し進むとシャドームーンと会話。
- その後直進してショートカットを抜け、中心の広間に入って少し進むとシャドームーンとの戦闘。
斬撃の威力が高いので注意。
18-マネー・ドーパントの挑戦 
条件:
報酬:金塊×3
場所:ウルトラ・キューブ-第2層-トーナメント会場
必要キャラ:なし
クリア条件:賭けに勝つ、もしくはマネーD撃破
ボス:マネーD
- トーナメント会場は第2中継地点からすぐのところにある。
- レッドキングが負けるほうを選ぶとマネーDとの戦闘無しにクエスト達成。
- エレキングが負けるほうか引き分けを選ぶとマネーDと戦闘になる。HPが12800と高めだが、攻撃力等は雑魚とそれほど変わりないので苦戦することもないはず。
なおマネーDを撃破すると蛍石が手に入る。
19-明鏡止水の境地 
条件:ヴェーダ・キューブ中継地点2到達
報酬:ゴッドガンダムのスキルツリー開放
場所:デザート・キューブ-荒野地帯-貯水池
必要キャラ:ゴッドガンダム
ボス:マスターガンダム
- 貯水池に行くとイベント
- マスターガンダムと戦闘
ヴェーダ・キューブでのボス戦と同性能。HPが減ってくるとハイパーモードになる
20-ダブルオーへの果たし状 
条件:サブクエスト15クリア、ヴェーダ・キューブ中継地点2到達
報酬:シラヌイ、ウンリュウ
場所:ヴェーダ・キューブ-中層-ターミナルユニット
必要キャラ:ダブルオー
ボス:スサノオ
- 中継地点2近くに待っているスサノオに話しかける
- 目標を、いざ尋常に、勝負!駆逐する!
- スサノオと戦闘。HPが減ってくるとトランザムを使ってくる。
通常時は攻撃も速度も低めだが、トランザム状態では大幅にアップする。こちらのHPが低いと一撃死もありえるので注意。
25-復活のグリード 
条件:ウヴァ撃破
報酬:俊敏の結晶、魔力の結晶、運気の結晶
場所:ウルトラ・キューブ-第2層-リング部屋
必要キャラ:オーズ
ボス:ウヴァ、ガメル、メズール
- ウヴァと戦闘した部屋に行くとウヴァ、ガメル、メズールと戦闘になる
ボス三体と同時戦闘なので出現直後に行くとかなり厳しい
メズールが炎弱点なのでそこを突いて数ターンで沈められれば多少マシになる
ウヴァは直前に戦ったときとほぼ同じだが初戦闘のガメルの攻撃力が高いので注意
なお、ここにくるまでに雑魚で出るマスカレイド・ドーパントと
リジェスファイトで戦うグランザイラス、カブトヤミーのチップを手に入れていれば
ガメルを倒せばチップドロップ率UPのフォースを入手できるので多少無理する価値はある