アイテム 
破壊できるオブジェクトから出現、特定の敵を倒すと出現、特定の位置に初めから出現などのパターンがある。
- 体力ゲージ回復
握り飯、にぎり。
それぞれ25％回復、50％回復する。
隠密（熊）、傀儡ウォーカーを撃破すると25％回復するものを1個落とす。（忍務によっては落とさない）
- 忍法ゲージ回復
巻物。1本、3本と回復量が違うものが登場。
上忍を撃破すると1本分回復するものを1個落とす。（忍務によっては落とさない）
- 全回復
太巻き。体力ゲージ全回復＋忍法ゲージ5本まで回復の強力な効果。
- 能力変化
光る珠のグラフィック。赤色の珠(攻撃)、青色の珠(防御)、黄色の珠(不死)の3種。
それぞれ一定時間、操作キャラの攻撃力(防御力)が上昇(約2倍)したりダメージを一切受けなくなったりする(無敵化は吹き飛ばなくもなる)。
同じ効果は重複しない(攻撃上昇、防御上昇、無敵化を同時に得ることはできる)
通常の忍務でも出現する。
- 衣装耐久力回復
裁縫セットのグラフィック。衣装耐久力（ゲーム中では確認できない）が回復する。
衣装を破壊されていないと効果がない。1個で1段階ずつ回復する。
（対戦モードで登場）
- 特殊効果
忍玉。
火炎、猛毒、電撃、氷結、忍封、隠れ、変り、召喚、回復、傀儡の10種。
傀儡は黄、赤、青、緑、黒の5種類があるが何が出てくるかはランダム。
雑魚敵
今作もリーダーキャラの存在がないため、同じマップで何度か増援が出ることがある。
- 傀儡
木偶人形。
本編忍務では途中から胴に『改』と書かれた傀儡（改）が出る。
『爆』以上にすると溜めてから吹き飛ばし性能のあるダッシュ攻撃をするようになる。
- 一般制徒
短刀を構えたブラウス姿の忍学生。注意してみると髪形が数種類程度存在する。
『爆』以上では吹き飛ばし性能のあるダッシュ攻撃が追加される。
- 下忍
クナイを使って攻撃する下級の忍。近距離での攻撃は2回連続で繰り出される。
『爆』以上になると傀儡と同じく高威力のダッシュ攻撃をするようになるほか、遠距離からでも手裏剣を投げて攻撃してくるようになる。
- 中忍
弓矢を使う中級の忍。攻撃は直線的だが3連射される。動きが鈍いので接近すれば勝機はある。
『爆』以上では攻撃の威力が大幅に増し、しゃがんだ姿勢から同時に数本の矢を放つ高威力の攻撃と、小ジャンプから吹き飛ばし性能を持つ爆弾を投げつける攻撃が追加される。
- 上忍
刀を携える忍。振り下ろし攻撃など多彩な技を持ち、突きには吹き飛ばし性能がある。
攻撃時の構えに仰け反らなくなる特性が付くので無闇に攻めると手痛い反撃を喰らってしまう。
『爆』以上ではジャンプ斬りが追加。ガード不能で非常に手強い。
倒すと忍法ゲージ1本分を回復するアイテム（巻物）を1個落とす。
- 隠密（狢/鴉/熊/鼠/亀/猿/兎/狼/羊/梟）
熊を倒すと体力25％回復アイテム（おにぎり）を1個落とす。
羊を倒すと忍玉（電撃）を1個落とす。
鼠を倒すと忍玉（忍務によって異なる）を1個落とす。
亀：遠距離から大砲で攻撃してくる。難易度『絶』になると頻繁に防御体勢を取るようになり、衣装破壊前の防御体勢を取っている亀に防御崩し技を当てると必ず地面を背にして回転しながらの移動攻撃を行う。この攻撃は完全無敵かつ防御不能。防御を崩されてからこの無敵攻撃に移行するまでの時間差はゼロであり、プレイヤーキャラクターは防御不可攻撃を持っていないので(秘伝忍法は防御崩し)、防御姿勢を取っている衣装破壊前の亀を崩すのは不可能。防御体勢を取っていない時でもこちらの攻撃に合わせて当身技を行ってくる場合がある。
兎：こちらから近付いても素早い移動で距離を取り、他の敵を攻撃している隙などに攻撃をしてくる。難易度『絶』以上で同じエリアに衣装破壊前の亀がいる場合、それを攻撃して上述の移動攻撃を誘発させる。
- 傀儡ウォーカー
倒すと忍玉（傀儡）又は（おにぎり）を1個落とす。
強敵攻略
基本的には、困ったら秘伝忍法でさくっと倒す事。
忍転身や命駆する場合を除き、こいつらに時間をかけると評価も下がるうえ被弾率も上がる。
- 上忍
構え体制にハイパーアーマーを持ち、何も考えずに殴ってるとそのまま攻撃される
威力も高く、これが数体出てくるステージでは思わぬ痛手を負う事も。
正面から殴るだけだと反撃され大ダメージを受けるので注意が必要。弾きが出来れば理想。
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