ポケモンは常に「性別」と呼ばれている特徴を持っている。説明書によれば「♂は相手に技の急所が当たりやすく、♀は回避が得意」。また、性別が無いポケモンはその階数に関係ない状態で登場する。ダンジョンの奇数階では♂のポケモン、偶数階では♀のポケモンのみが登場する。